Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZfaP23607 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZfaP23607 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms