Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ggta1P23336 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ggta1P23336 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggta1P23336 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms