Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Edn1P22387 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Edn1P22387 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edn1P22387 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms