Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp42P22227 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp42P22227 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms