Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc2P20801 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc2P20801 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc2P20801 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms