Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prim1P20664 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim1P20664 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim1P20664 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim1P20664 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prim1P20664 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prim1P20664 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim1P20664 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prim1P20664 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms