Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf3P20181 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf3P20181 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntf3P20181 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms