Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lsp1P19973 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsp1P19973 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms