Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ms4a1P19437 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a1P19437 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a1P19437 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms