Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csn1s1P19228 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csn1s1P19228 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn1s1P19228 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms