Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifrd1P19182 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifrd1P19182 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms