Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt19P19001 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt19P19001 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt19P19001 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt19P19001 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms