Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcnaP17918 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcnaP17918 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcnaP17918 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms