Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna1P16388 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna1P16388 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms