Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnc1P15388 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnc1P15388 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnc1P15388 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms