Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd44P15379 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd44P15379 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms