Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrphP15331 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrphP15331 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrphP15331 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrphP15331 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrphP15331 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrphP15331 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrphP15331 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrphP15331 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrphP15331 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrphP15331 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrphP15331 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrphP15331 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrphP15331 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrphP15331 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrphP15331 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PrphP15331 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrphP15331 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrphP15331 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrphP15331 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrphP15331 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrphP15331 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrphP15331 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrphP15331 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrphP15331 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrphP15331 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrphP15331 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrphP15331 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrphP15331 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrphP15331 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms