Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a1P11087 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a1P11087 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a1P11087 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a1P11087 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col1a1P11087 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col1a1P11087 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col1a1P11087 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms