Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nid1P10493 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nid1P10493 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nid1P10493 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nid1P10493 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nid1P10493 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms