Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Schip1P0DPB4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Schip1P0DPB4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Schip1P0DPB4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms