Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3cP0DOY1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dnmt3cP0DOY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms