Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Becn2P0DM65 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms