Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6c1P0CW02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6c1P0CW02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms