Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax1P09084 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax1P09084 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax1P09084 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms