Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc8P09025 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc8P09025 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxc8P09025 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc8P09025 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms