Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa1P09022 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms