Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa5P09021 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms