Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NeflP08551 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NeflP08551 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NeflP08551 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NeflP08551 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NeflP08551 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NeflP08551 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NeflP08551 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NeflP08551 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NeflP08551 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NeflP08551 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NeflP08551 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NeflP08551 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NeflP08551 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NeflP08551 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NeflP08551 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NeflP08551 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NeflP08551 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NeflP08551 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NeflP08551 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms