Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Col3a1P08121 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col3a1P08121 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms