Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna5P07349 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna5P07349 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms