Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrlP06879 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrlP06879 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrlP06879 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrlP06879 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrlP06879 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrlP06879 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrlP06879 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrlP06879 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrlP06879 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrlP06879 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrlP06879 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrlP06879 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrlP06879 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrlP06879 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms