Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa4P06728 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms