Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06330 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06330 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06330 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06330 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06330 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06330 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06330 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06330 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06330 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06330 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06330 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms