Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Got1P05201 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Got1P05201 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Got1P05201 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Got1P05201 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Got1P05201 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Got1P05201 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Got1P05201 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Got1P05201 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Got1P05201 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Got1P05201 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Got1P05201 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Got1P05201 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Got1P05201 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Got1P05201 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Got1P05201 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Got1P05201 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Got1P05201 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Got1P05201 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Got1P05201 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Got1P05201 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Got1P05201 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Got1P05201 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Got1P05201 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms