Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa7P02830 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa7P02830 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms