Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01820 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01820 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01820 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01820 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01820 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01820 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01820 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01820 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms