Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01791 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01791 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01791 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01791 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01791 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01791 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01791 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01791 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01791 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01791 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01791 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01791 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms