Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01789 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01789 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01789 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01789 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01789 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01789 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01789 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01789 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms