Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01728 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01728 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01728 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01728 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01728 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01728 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01728 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01728 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01728 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01728 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01728 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01728 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01728 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01728 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01728 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms