Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01727 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01727 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01727 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01727 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01727 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01727 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01727 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01727 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01727 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01727 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01727 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01727 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms