Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01673 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01673 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01673 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01673 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01673 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01673 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01673 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
P01673 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01673 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01673 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01673 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01673 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01673 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01673 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01673 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01673 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01673 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01673 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01673 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01673 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01673 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01673 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01673 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01673 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01673 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01673 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01673 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01673 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01673 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms