Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P01641 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P01641 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P01641 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P01641 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P01641 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01641 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01641 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01641 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01641 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
P01641 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
P01641 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P01641 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P01641 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01641 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01641 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01641 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01641 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01641 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01641 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01641 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01641 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01641 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01641 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01641 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01641 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms