Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mtatp6P00848 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms