Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abl1P00520 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abl1P00520 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abl1P00520 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms