Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lancl1O89112 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lancl1O89112 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lancl1O89112 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms