Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Casp8O89110 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Casp8O89110 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms