Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde4aO89084 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pde4aO89084 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde4aO89084 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms