Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setdb1O88974 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setdb1O88974 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms