Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apaf1O88879 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apaf1O88879 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apaf1O88879 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms