Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DcxO88809 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DcxO88809 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DcxO88809 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DcxO88809 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DcxO88809 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DcxO88809 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DcxO88809 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DcxO88809 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DcxO88809 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DcxO88809 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DcxO88809 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DcxO88809 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DcxO88809 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DcxO88809 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DcxO88809 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DcxO88809 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DcxO88809 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DcxO88809 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DcxO88809 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DcxO88809 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DcxO88809 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DcxO88809 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms